Kaşif Kozinoğlu, Bosna-Hersek ve Afganistan’da uzun süreli görev yaptıktan sonra 2011 yılında tutuklanmış ve 12 Kasım 2011'de Silivri Cezaevi'nde spor sonrası kalp krizi geçirerek hayatını kaybetmiştir; ailesi ölümün normal olmadığını belirterek soruşturma açılmasını talep etmiş, ancak ilk soruşturma bir yıl sonra kapatılmıştı.
Ölüm anında gardiyan Ferhat Veysi Gül'ün radyoyu açarak yardım seslerinin duyulmasını engellediği iddiası ve Gül'ün FETÖ üyesi olduğu, 15 Temmuz darbe girişiminden sonra yurt dışına kaçtığı yönündeki iddialar, dosyanın yeniden açılmasına yol açtı; bazı çevreler Kozinoğlu'nun zehirlenmiş olabileceğini öne sürmektedir.
Soruşturma kapsamında 7 Eylül'de ilk operasyon gerçekleştirildi; cezaevinde görev yapan 11 kişi hakkında gözaltı kararı verildi, bu kişilerden 10'u gözaltına alındı ve bir jandarma eriydi tutuklandı, 7 kişi ise adli kontrol şartıyla serbest bırakıldı. 10 Eylül'de ikinci dalga operasyonla bir kameraman, bir muhabir ve sağlık çalışanları da dahil olmak üzere 9 şüpheli gözaltına alındı; mahkeme, gazeteci Selahattin Günday da dahil olmak üzere üç kişiyi tutukladı.
Üçüncü dalga operasyonunda eski savcılar Ali İşgören ve Necip Doğan tutuklama kararıyla gözaltına alındı; aynı anda emekli asker Hasan Atilla Uğur ve Hasan Ataman Yıldırım için ev hapsi kararı verildi. Dördüncü dalga operasyonunda eski gazeteci Osman Arslan ile ifadeye çağrılan Enver Altaylı da tutuklanarak soruşturmadaki tutuklu sayısı sekize yükseldi.
Köşe dizisi "Kurtlar Vadisi Pusu"da "Kazım Kaşifoğlu" karakterini canlandıran Sedat Savtak, bilgi sahibi olduğu gerekçesiyle Silivri Adliyesi'ne giderek ifade verdi. Aynı dizi içinde "Ömer Baba" rolünü oynayan Emin Olcay da soruşturma kapsamında ifade verdi ve basına, "Gördüklerimi bildiklerimi anlattım… Allah yardımcıları olsun" diyerek, ölen subayların ölümünün aydınlatılması için savcıların yoğun bir çalışma yürütmesi gerektiğini vurguladı.